Die Nepomuk-Apotheke ist nach ISO 9001:2015 & ApoBetrO zertifiziert. Die Zertifizierung umfasst den Apothekenbetrieb, Beratung und Dienstleistungen sowie den Versandhandel und die Vorsorge sowie die Belieferung von Heimen, Pflegeeinrichtungen und Ambulanzen. Das aktuelle Zertifikat ist bis 9. April 2026 gültig (Reg. Nr. 1298284 der Zentrale VQMA).